中医是以中国古代的唯物论和辩证法思想为哲学基础，以整体观念为指导思想的科学体系，以联系的、发展的、全面的观点去认识自然、认识生命。中医农业就是将中医原理和方法应用于农业领域，实现现代农业与传统中医的跨界融合，采用中草药生产的农药、兽药、肥料、饲料等投入品，部分或全部替代化学投入品以及基因工程获得的生物及其产物，充分发挥中草药的配伍功效及与其它生物群落相生相克的作用，优化动植物生长环境，营造有利于动植物健康生长的内在机制和外在因素，构建植物、动物、食用菌、微生物以及诸多其它生物的和谐生态体系。

土壤是一切生物赖以生存的家园，是植物动物、昆虫、及微生物的生活空间和物质营养来源，也是人类生存和发展的基础。过去，在以高产为目的的现代农业的耕作体系下，由于大量使用农药化肥，且对土壤的高强度使用与消耗，而不重视养地，造成土壤养分失调，有机质水平大大降低，土壤地力下降，保水保肥能力下降，土壤退化与沙化、草原退化现象等严重，使得农业生产更加依赖于化肥的追加以及大量水资源的消耗，农业持续生产力脆弱，且治理难度大，成本高，并且，随着越来越多的重金属进入农田，土壤污染越来越严重。

中医农业具有三个方面的特点：一是系统性，即着重农业生态系统以及生物体各部分的内在联系，这是农业内部保持各组成部分之间相对稳定和谐的本质要求;二是综合性，即形成多方面、多层次的复合效应，也就是通过综合的手段，达到综合的效果;三是整体性，即作用范围是整个的、全部的，强调覆盖所有生产单元和种养循环链。

中医学理论中，提倡扶助正气，增强体质，提高机体的抗邪能力。对于农业来说，就是供给农作物、畜禽必须的基础营养和努力营造他们良好的生长环境，促进健壮生长，提高抵抗力。就农作物来说，主要抓培土改土、补水保湿、通风透光等。

人是一个有机的整体，人和自然界是一个有机的整体，人和社会也具有统一性。人处于天地气交之中，人的健康和天地自然环境息息相关。现代农业随着科技水平的提升，与自然节奏相统一的自然生态农业是是“天人合一”的境界。道法自然、尊重自然、顺应自然、保护自然, 改造自然，是全面建设社会主义现代化国家和发展中医农业的基本要求。